docs: 补全命令说明并把 README 按模块拆分

- Docker 命令表由纯名称列表改为「命令 / 作用 / 实际执行」三列，
  覆盖全部 33 条；补充顶部示例与选项解析的例外说明
- 新增 pkg.refreshindex 独立小节
- 按命令分组拆出 README.docker/net/disk/diagnose/proc/pkg.md，
  主 README 保留简介、用法速览与「命令一览」导航表
- 新增「文档要写在哪」小节，约定后续新增命令的文档归属

README.pkg.md

@@ -0,0 +1,36 @@
+# 系统软件包（`kopsc pkg <子命令>`）
+
+> 返回 [README.md](README.md)
+
+刷新系统包管理器的软件源索引。
+
+```bash
+kopsc pkg refreshindex    # 刷新包管理器索引（dnf/apt/apk/brew/winget，按平台自动选）
+```
+
+## 刷新软件源索引（pkg.refreshindex）
+
+`kopsc pkg refreshindex` 刷新本机包管理器的软件源索引，**只更新索引，不升级也不安装任何软件包**。
+常用于「刚换完源 / 报错说找不到某个包」时先同步一次。
+
+```bash
+kopsc pkg refreshindex        # 按当前平台自动选择：
+                              # Linux centos → dnf makecache
+                              # Linux ID_LIKE rhel/fedora → dnf makecache
+                              # Linux ID_LIKE debian/ubuntu → apt-get update
+                              # Linux alpine → apk update
+                              # macOS → brew update
+                              # Windows → winget source update
+```
+
+| 平台 | 实际执行 |
+| --- | --- |
+| Linux（`/etc/os-release` 的 `ID=centos`） | `dnf makecache` |
+| Linux（`ID_LIKE` 含 rhel / fedora） | `dnf makecache` |
+| Linux（`ID_LIKE` 含 debian / ubuntu） | `apt-get update` |
+| Linux（`ID=alpine`） | `apk update` |
+| macOS | `brew update` |
+| Windows | `winget source update` |
+
+- 需要相应包管理器的权限时（如 `apt-get update`），请以 root / sudo 运行 kopsc。
+- 更新索引本身不改动已安装的软件；要升级请用系统自带的包管理器命令。